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其研究涉及基因组学等组学，生物信息学大数据分析，机器学习和人工智能等多个领域。所涉及的科学问题，包括“什么是基因？各种进化压力下在物种、个体、细胞水平上基因是如何进化的？”、“人体基因与复杂性表型的关联？包括复杂性疾病，癌症，农业动植物性状”、“人体共生微生物和健康的关联？”、“生物信息学分析方法和数据库：基因组包括组装、注释、比较、多态性、表达、表观遗传、调控和进化在内的各种数据分析、工具和数据库开发。”
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